Boekhouder.nl
Vergelijking 2026

Advies voor e-commerce ondernemers

Boekhoudprogramma voor je webshop kiezen

Je wilt webshoporders automatisch importeren, betalingen van je betaalprovider (PSP) aan orders koppelen en retouren en btw goed verwerken. Zo bespaar je handmatig overtypen en sluit je administratie aan op je verkopen.

Welk pakket past, hangt af van je webshopplatform, voorraadbeheer in het pakket en samenwerking met je accountant. Controleer ook aparte koppelkosten en de voorwaarden om betalingen aan orders te koppelen.

Start hieronder de keuzehulp voor een gericht advies of bekijk direct de vergelijking van geschikte pakketten.

SNEL ANTWOORD PER SITUATIEBekijk uitleg
WooCommerce zelf doen
e-Boekhouden.nl
Shopify met Mollie-aflettering
Moneybird
Voorraad in de boekhouding
Silvasoft
Meerdere administraties en accountant
Exact Online
Shopify met internationale OSS
Jortt
Zo is deze pagina gemaakt:
  • Getoetst op WooCommerce- en Shopify-orderkoppelingen
  • Controle op PSP-aflettering (o.a. Mollie) en retourverwerking
  • Native voorraadmodules versus externe registers beoordeeld
  • Inzicht in directe btw-aangifte, OSS-rapportages en connectorkosten
Onderzoek en redactie
Boekhouder.nl Research Team
Software getest door
Shilpa Sitlani
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026
Commerciële relaties: worden vermeld
Bekijk methodologie
Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria. Lees hoe wij vergelijken en geld verdienen
Uitgelichte partnersAdvertentie · wij kunnen een vergoeding ontvangen. Hoe wij vergelijken
e-Boekhouden.nlVanaf € 9,95 p/m · directe btw-aangifte, gratis accountantslicentie
MoneyMonkVanaf € 9 p/m · alle functies in elk pakket, 30 dagen gratis proberen
ShineGratis pakket, betaald vanaf € 9 p/m · 30 dagen gratis proberen
Expert take
BR

Boekhouder.nl Research Team

Redactie zakelijke software

“Het beste pakket is het pakket dat past bij hoe jij werkt, niet het pakket met de laagste prijs.”

Mijn advies: Kies op werkwijze — bonnetjes scannen versus zelf uren schrijven — en niet alleen op prijs. Controleer ook of de btw-aangifte native in het pakket zit of alleen via een koppeling loopt.

In het kort

Welk boekhoudpakket bij je webshop past, hangt af van je webshopsoftware en je wensen voor voorraadbeheer.

  • WooCommerce of Shopify met een accountant: e-Boekhouden.nl en Moneybird passen bij deze situaties. Bij e-Boekhouden.nl kost Standaard + Factureren €12,00 tot €24,00 per maand excl. btw. Moneybird Compleet kost €41 tot €49 per maand excl. btw.
  • Voorraad direct in je boekhoudpakket: Silvasoft biedt voorraadadministratie met losse modules van €13,95, €8,95 en €7,95 per maand excl. btw.
  • Je uiteindelijke keuze: let op je betaalprovider, de verwerking van retouren en mogelijke extra kosten voor externe webshop- of bankkoppelingen.

Bron: openbare tarieven, peildatum 2 oktober 2026

Op deze pagina22 onderdelen

Kies de situatie die bij jouw webshop past

Welk boekhoudpakket past, hangt af van je webshopplatform, voorraadbeheer en samenwerking met je accountant.

Keuzehulp boekhoudsoftware voor webshops

Beantwoord een paar korte vragen en krijg twee tot vier passende pakketten, met uitleg, een kostenindicatie en punten om bij de aanbieder te controleren. Je hebt geen e-mailadres nodig en je antwoorden blijven alleen lokaal bewaard.

1. Wat voor webshop heb je?Kies wat het best aansluit
2. Hoeveel bestellingen verwerk je maandelijks?Een schatting is genoeg
3. Wat vind je het belangrijkst?Kies maximaal 3 prioriteiten
4. Hoe doe je de boekhouding nu?Kies wat het meest lijkt

Beantwoord minimaal vraag 1 t/m 3

Boekhoudpakketten vergeleken

Per pakket zie je waar het het best bij past, wat het ongeveer kost en wat de belangrijkste beperking is. "Beste voor" zegt iets over geschiktheid — niet over commissie.

Beste voor zelfstandige webshops met WooCommerce

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van e-Boekhouden.nl
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
Gratis, extra gebruikers kosten niets extra.
Extra administratie
Eén abonnement per administratie; accountants betalen staffel vanaf €3,95.
Koppelingen
Knab en ASN €0,99 p/m; externe partners rekenen eigen kosten.

Waarom aanbevolen: Dit pakket past bij zzp'ers en startende ondernemers die een betaalbare administratie zoeken en zelf hun btw-aangifte willen indienen. Je regelt je administratie via een overzichtelijke webomgeving en krijgt gratis telefonische ondersteuning als je vastloopt.

Minder geschikt als: je meer dan 240 boekingen per jaar verwerkt of een Engelstalige interface zoekt — dan moet je verplicht upgraden naar een duurder pakket of loop je vast op de taal.

Belangrijkste beperking: Het ZZP-pakket stopt bij 240 boekingen per jaar; controleer vooraf je transactievolume om onverwachte kosten te voorkomen.

Standaard + Factureren

€24/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€24/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: Standaard + Factureren

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor Shopify-webshops met een adviseur

Moneybird

Online boekhoudpakket

Commerciële partner

Bron: review van Moneybird
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
1 in Start, 5 in Groei, onbeperkt in Compleet
Extra administratie
Aparte administraties vereisen een eigen abonnement vanaf €3 per maand
Koppelingen
Ponto-banken, webshops zoals Shopify en salarissoftware via API
Salarisadministratie
Via koppeling met externe software zoals Nmbrs of Employes

Waarom aanbevolen: Moneybird past bij zzp'ers en dienstverleners die offerte, factuur en betaling in één overzichtelijk proces willen beheren. Doordat je gewerkte uren direct factureert met een betaallink, staat je omzet sneller op je rekening.

Minder geschikt als: je telefonische hulp bij spoed verwacht of een grote handelsvoorraad hebt — dan ben je aangewezen op trage chathulp en moet je extra voorraadsoftware betalen.

Belangrijkste beperking: Bij de transactielimiet blokkeert de verwerking; controleer je bankvolume of stap op tijd over naar een ruimer pakket.

Compleet

€41/maandOnbeperkt transacties en bankkoppelingen

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€41/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: Compleet

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor webshops met eigen voorraadbeheer

Silvasoft

Online boekhoudpakket (modulair)

Commerciële partner

Bron: review van Silvasoft
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
20% korting op modulekosten per extra gebruiker
Extra administratie
Volledige moduleprijs per extra administratie
Koppelingen
Banken via Ponto (€4,00 p/m), WooCommerce, Shopify, Mollie
Salarisadministratie
Nee, alleen personeelsmanagement (HRM)

Waarom aanbevolen: Silvasoft werkt modulair: je betaalt alleen voor je actieve modules en kunt later eenvoudig functies toevoegen naarmate je bedrijf groeit.

Minder geschikt als: je vooral aan consumenten verkoopt — dan kun je prijzen niet inclusief btw tonen en moet je bedragen handmatig omrekenen.

Belangrijkste beperking: Silvasoft is bij dataverlies tot 120 uur niet aansprakelijk; maak daarom regelmatig zelf exports van je administratie.

Boekhouden

€13,95/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€13,95/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: Boekhouden

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor eenvoudige webshops en mobiel werken

Rompslomp

Online boekhoudpakket

Commerciële partner

Bron: review van Rompslomp
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
Professional/Master: 2-3 inbegrepen, daarna €3,- per maand
Extra administratie
Professional/Master: €10,- per maand per extra administratie
Koppelingen
Bankkoppeling €3,- p/m extra; webshopkoppelingen via betaalde externe partners
Salarisadministratie
Nee

Waarom aanbevolen: Past bij zzp'ers en eenmanszaken die zonder boekhoudkennis snel mobiel facturen willen sturen en bonnen willen bijhouden. Je regelt je offertes en dagelijkse administratie direct onderweg via een eenvoudige app op je telefoon.

Minder geschikt als: je personeel in dienst hebt of een bv runt — dan mis je salarisverwerking en loop je vast op het ontbreken van een standaard grootboekschema.

Belangrijkste beperking: Instappakketten hebben limieten op uitgaven; controleer vooraf of je daardoor naar een duurder pakket moet overstappen.

Professional

€26,50/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€26,50/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: Professional

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor direct btw betalen met iDEAL

InformerOnline

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van InformerOnline
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
€10 per maand, alleen in MKB Plus
Extra administratie
€10 per maand, alleen in MKB Plus
Koppelingen
Rabobank, bunq, ING, Knab, Ponto, webshops, Mollie

Waarom aanbevolen: Past bij zzp'ers en mkb-bedrijven die hun administratie en btw-aangifte zelfstandig willen beheren. Je verstuurt en betaalt de btw-aangifte direct via iDEAL zonder dat je eHerkenning nodig hebt.

Minder geschikt als: je een vaste prijs zonder extra toeslagen zoekt — dan lopen je kosten maandelijks op door losse toeslagen voor bankkoppelingen en scans.

Belangrijkste beperking: Elke bankkoppeling kost minimaal €1 per maand extra; controleer vooraf de kosten voor je bank.

MKB Plus

€45/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€45/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: MKB Plus

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor voorraad bijwerken na retouren

Visma eAccounting

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van Visma eAccounting
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
€2,75 per extra gebruiker per maand
Extra administratie
Aparte licentie vereist per extra administratie
Koppelingen
2 bankkoppelingen inbegrepen; extra koppeling kost €2,25 per maand
Salarisadministratie
Nee — werkt via koppeling met Nmbrs of Loket

Waarom aanbevolen: Past bij ondernemers die zelf facturen en bonnen verwerken en soepel willen samenwerken met hun boekhouder. Doordat je bank en btw-aangifte direct koppelt, voorkom je overtypwerk en doe je de kwartaalaangifte met één klik.

Minder geschikt als: je zonder boekhoudkennis een eenvoudig pakket zoekt — dan ervaar je de interface als te complex en maak je snel fouten.

Belangrijkste beperking: Oude transacties importeren kan niet; controleer vooraf of je zelf een nieuwe beginbalans kunt opstellen.

Standaard

€28/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€28/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: Standaard

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor samenwerken met je eigen boekhouder

SnelStart

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van SnelStart
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Extra gebruikers
1 inbegrepen, daarna €2.50 tot €13.50 per maand per gebruiker
Extra administratie
€3.50 per maand per extra online administratie
Koppelingen
Banken, webshops zoals Shopify en WooCommerce, en diverse betaalproviders

Waarom aanbevolen: Past bij ondernemers die een vertrouwde Nederlandse boekhouding zoeken en nauw willen samenwerken met hun boekhouder of accountant. Je verwerkt administratieve taken sneller doordat facturen en bonnetjes automatisch worden herkend en klaargezet voor verwerking.

Minder geschikt als: je handelt in margegoederen of factureert in vreemde valuta — dan loop je direct vast op het ontbreken van valutakoersen en de individuele margeregeling.

Belangrijkste beperking: Bij opzegging wist SnelStart alle clouddossiers direct; maak op tijd zelf een back-up via het Windows-desktopprogramma.

inBalans

€39,50/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€39,50/maand

Scenario: WooCommerce · Zelfstandige administratie

Aanbevolen pakket: inBalans

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Wat kost boekhoudsoftware voor jouw webshop echt?

De pakketprijs is maar een deel van het verhaal. De totale kosten hangen af van je gebruik.

Totale kosten = pakketprijs + kosten per extra gebruiker + kosten per extra administratie + kosten voor modules en koppelingen (bank, webshop, salaris).
Kies een scenario:
e-Boekhouden.nlOnline boekhoudsoftware
Per maand€24/maand
Aanbevolen pakket: Standaard + Factureren
Bekijk
MoneybirdOnline boekhoudpakket
Per maand€41/maand
Aanbevolen pakket: Compleet · Onbeperkt transacties en bankkoppelingen
Bekijk
SilvasoftOnline boekhoudpakket (modulair)
Per maand€13,95/maand
Aanbevolen pakket: Boekhouden
Bekijk
RompslompOnline boekhoudpakket
Per maand€26,50/maand
Aanbevolen pakket: Professional
Bekijk
InformerOnlineOnline boekhoudsoftware
Per maand€45/maand
Aanbevolen pakket: MKB Plus
Bekijk
Visma eAccountingOnline boekhoudsoftware
Per maand€28/maand
Aanbevolen pakket: Standaard
Bekijk
SnelStartOnline boekhoudsoftware
Per maand€39,50/maand
Aanbevolen pakket: inBalans
Bekijk
JorttOnline boekhoudpakket
Per maand€39,95/maand
Aanbevolen pakket: Jortt Plus · Onbeperkt gebruikers, inclusief Scan en Herken
Bekijk
Exact OnlineOnline boekhoudsoftware (mkb/accountant)
Per maand€99/maand
Aanbevolen pakket: Plus · 2 administraties, 2 gebruikers, 100 verkoopfacturen/maand

Dit is een bandbreedte op basis van openbare tarieven (peildatum 2 oktober 2026), excl. btw. Werkelijke kosten hangen af van je gebruik.

Vergelijk pakketten

Bekijk de belangrijkste verschillen tussen pakketten naast elkaar.

Pakketten (3/4):

Veeg opzij om alle pakketten te zien.

Kenmerk

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudsoftware

Moneybird

Online boekhoudpakket

Silvasoft

Online boekhoudpakket (modulair)

Beste voorzelfstandige webshops met WooCommerceShopify-webshops met een adviseurwebshops met eigen voorraadbeheer
Geschatte maandkosten€24/maand€41/maand€13,95/maand
InstappakketStandaard + Factureren · €24/maandCompleet · €41/maandBoekhouden · €13,95/maand
Btw-aangifteDirecte elektronische btw- en ICP-aangifte bij Belastingdienst.Directe btw- en ICP-aangifte indienen vanaf pakket StartDirecte btw- en ICP-aangifte; geen KOR of IB
BankkoppelingGratis via o.a. ING en Rabobank; overige €0,99 p/m.Ponto-bankkoppeling vanaf Groei of eigen Moneybird BetaalrekeningKoppeling via Ponto met alle Nederlandse banken
KoppelingenWebshops, payment providers en externe CRM via partners of API.Open API voor webshops, kassa's en salarissoftwareWooCommerce, Shopify, Mollie en REST API
Toegang accountantGratis meekijken voor accountant via eigen accountantlicentie.Gratis omgeving Mijn kantoor voor accountants en boekhoudersGratis meekijktoegang via een speciaal accountantportaal
Belangrijkste beperkingHet ZZP-pakket stopt bij 240 boekingen per jaar; controleer vooraf je transactievolume om onverwachte kosten te voorkomen.Bij de transactielimiet blokkeert de verwerking; controleer je bankvolume of stap op tijd over naar een ruimer pakket.Silvasoft is bij dataverlies tot 120 uur niet aansprakelijk; maak daarom regelmatig zelf exports van je administratie.
Laatst gecontroleerd2 oktober 20262 oktober 20262 oktober 2026
Volgende stapBekijkBekijkBekijk

Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria.

Wanneer is handmatige orderverwerking niet meer genoeg?

Wanneer heb je automatische verwerking nodig? Als startende webwinkelier kun je verkoopfacturen en banktransacties handmatig bijhouden in Excel of een basispakket. Dat werkt niet meer goed zodra je meer orders krijgt of betalingen via een betaalprovider (PSP) zoals Mollie verwerkt.

Een PSP betaalt regelmatig meerdere betalingen tegelijk uit en houdt de transactiekosten alvast in. Zonder automatische koppeling sluiten je webshopfacturen daardoor niet aan op het nettobedrag dat je op je bankrekening ontvangt.

Wanneer zijn retouren, btw en voorraad te complex? Je ontgroeit een eenvoudig systeem in deze situaties:

  • Retouren en creditfacturen vragen handwerk: bij terugbetalingen via je PSP moet je zowel de omzet als de btw corrigeren in de juiste aangifteperiode. Alleen de banktransactie boeken is niet voldoende.
  • Je overschrijdt de KOR-grens: gebruik je de kleineondernemersregeling (KOR), dan vervalt de btw-vrijstelling direct vanaf de transactie waarmee je de grens van €20.000 per kalenderjaar overschrijdt.
  • Je verkoopt meer aan EU-consumenten: zodra je meer dan €10.000 verkoopt aan consumenten in andere EU-landen, val je onder de Unie-OSS-regeling, het Europese éénloketsysteem voor btw. Een standaard btw-module is dan niet meer voldoende voor de vereiste kwartaaloverzichten per land.
  • Je wilt ook voorraad bijhouden: wil je voorraadwijzigingen bijhouden zonder handmatige tellingen? Dan heb je software met voorraadadministratie of een externe voorraadkoppeling nodig.

Hoe beheer je gebruikers en toegangsrechten?

Wie krijgt toegang tot welke gegevens? Bij een webshop werken vaak meerdere mensen in de systemen. De webshopbeheerder verwerkt orders, logistieke medewerkers beheren retouren en een boekhouder controleert de balans. Controleer daarom welke gebruikersrechten en licenties het pakket biedt.

Welke gebruikers zijn inbegrepen?

  • Moneybird Compleet: het abonnement heeft geen limiet op het aantal gebruikers.
  • e-Boekhouden.nl: je kunt gratis extra gebruikers toevoegen.
  • Rompslomp Professional: het pakket bevat standaard 2 extra gebruikers.
  • Exact Online Boekhouden Plus: het pakket bevat standaard 2 gebruikers. Iedere extra gebruiker kost €23 per maand.
  • InformerOnline MKB Plus: iedere extra gebruiker kost €10 per maand.
  • SnelStart inBalans: het pakket bevat standaard 1 gebruiker. Extra gebruikers moet je tegen het geldende tarief bijboeken.

Controleer vooraf of je per rol specifieke rechten kunt instellen. Zo kunnen externe magazijnmedewerkers of administratieve krachten niet zomaar bij privacygevoelige gegevens of bankrekeningen.

Wanneer heb je meerdere administraties nodig?

Vallen je webshops onder hetzelfde bedrijf? Heb je meerdere webshops binnen dezelfde bv of eenmanszaak? Dan volstaat één administratie. Je scheidt de verkoopkanalen met aparte grootboekrekeningen, de categorieën in je boekhouding, of met labels.

Heb je een holding met een werkmaatschappij of meerdere bv's? Dan vereist de Belastingdienst een strikt gescheiden boekhouding per juridische entiteit, zoals elke afzonderlijke bv.

Wat kosten extra administraties? Pakketten gaan verschillend om met meerdere administraties:

  • Exact Online Boekhouden Plus: standaard zijn 2 administraties inbegrepen. Een extra administratie kost €20 per maand.
  • InformerOnline MKB Plus: een extra administratie kost €10 per maand.
  • SnelStart: een extra online administratie kost €3,50 per maand.
  • e-Boekhouden.nl: je voert één administratie per abonnement.
  • Jortt: je hebt een apart abonnement per gekoppelde onderneming nodig. Dat kost €39,95 per maand per administratie.
  • Moneybird Compleet: je hebt een apart abonnement per gekoppelde onderneming nodig.

Breng vooraf in kaart hoeveel juridische entiteiten je beheert. Zo voorkom je dat de abonnementskosten voor meerdere entiteiten ongemerkt oplopen.

Welke rapportages heb je als webwinkelier nodig?

Welke btw-aangiftes kun je rechtstreeks indienen? Als webwinkelier heb je overzicht nodig over je btw. Veel pakketten kunnen de gewone Nederlandse btw-aangifte en ICP-opgaaf rechtstreeks naar de Belastingdienst sturen. De ICP-opgaaf is een overzicht van je leveringen en diensten aan ondernemers in andere EU-landen. Onder meer e-Boekhouden.nl, Silvasoft, Rompslomp, InformerOnline en Exact Online bieden deze verzending.

Let op de grenzen van de software:

  • Unie-OSS-rapportages: de kwartaalaangifte voor verkopen aan consumenten in andere EU-landen loopt via het éénloketsysteem van de Belastingdienst. Pakketten zoals Jortt maken een OSS-rapport waarmee je de cijfers handmatig indient. Ze dienen dit niet automatisch in zoals een standaard btw-aangifte.
  • Indicatieve btw-overzichten: software zoals WeFact biedt alleen een btw-overzicht als indicatie. Het levert geen volwaardige auditfile, een exportbestand voor je boekhouder, voor de jaarrekening.

Welke jaarstukken horen bij je rechtsvorm? Een balans en winst-en-verliesrekening helpen bij het afsluiten van je boekjaar. Ze vormen niet automatisch een jaarrekening die je bij KVK hebt ingediend.

Met een eenmanszaak betaal je inkomstenbelasting over je winst. Je hoeft geen jaarrekening bij KVK te deponeren.

Met een bv moet je aangifte vennootschapsbelasting doen en de jaarrekening digitaal bij KVK deponeren. Boekhoudsoftware voor webshops regelt deze deponering doorgaans niet zelfstandig. Daarvoor heb je aanvullende fiscale software of hulp van een accountant nodig.

Hoe koppel je webshop, betaalprovider en bank?

Hoe importeer je webshoporders? Een orderkoppeling zet bestellingen automatisch om in verkoopfacturen of journaalposten: boekingen in je administratie.

  • WooCommerce: onder meer e-Boekhouden.nl en Silvasoft bieden directe of gratis koppelingen. Bij SnelStart inBalans betaal je voor de koppeling vanaf €15 per maand, plus €250 eenmalige inrichtingskosten.
  • Shopify: de meeste aanbieders werken met externe koppelpartners, zoals Webwinkelfacturen. Dit geldt onder meer voor InformerOnline, Rompslomp, Moneybird en Jortt.

Hoe koppel je Mollie-betalingen aan facturen? Een betaallink op een factuur is niet hetzelfde als automatisch afletteren: betalingen aan openstaande facturen koppelen. Voor een correcte boekhouding moet de software verzameluitbetalingen uitsplitsen. Het gaat om bruto-omzet, transactiekosten, terugbetalingen en eventuele chargebacks: terugboekingen na een betwiste betaling.

  • Moneybird: verwerkt terugbetalingen en chargebacks automatisch, mits externe webshopfacturen het specifieke Mollie-transactie-ID bevatten.
  • Exact Online: gebruikt hiervoor een specifieke Mollie-aflettermodule.
  • Jortt Plus: koppelt Mollie-ontvangsten en -kosten aan de juiste boekingen, mits het betaalkenmerk uit de Shopify-checkout meekomt.

Hoe komen banktransacties binnen? Controleer hoe het pakket je banktransacties ontvangt. Directe bankkoppelingen via PSD2 zijn gangbaar. Bij koppelingen via tussenpartijen zoals Ponto gelden vaak extra tarieven.

Heb je Peppol nodig? Verschillende pakketten ondersteunen Peppol, een netwerk voor elektronische facturen. Voor gewone webshopverkopen aan consumenten (B2C) is Peppol op dit moment niet vereist.

Welke kosten komen boven op je abonnement?

Wat betaal je buiten het basisabonnement? Naast je vaste softwareabonnement krijg je bij een webshop te maken met specifieke variabele kosten. Gebruik de kostenmodule hierboven om je situatie door te rekenen. Let daarbij op de volgende kostenposten.

Wat kosten externe koppelingen? Externe partijen, zoals Webwinkelfacturen, beheren regelmatig webshop- en PSP-koppelingen. Ze rekenen eigen abonnementskosten op basis van het aantal transacties. SnelStart rekent voor de WooCommerce-koppeling vanaf €15 per maand en €250 eenmalige inrichtingskosten.

Wat kosten voorraad- en handelsmodules? Voorraadbeheer in je boekhoudpakket zit vaak niet in het basisabonnement:

  • InformerOnline: de Handelsmodule kost €15 per maand extra.
  • Silvasoft: Product- & voorraadbeheer kost €7,95 per maand.
  • Visma eAccounting: de module Voorraad kost €12 per maand.

Wat kosten bankkoppelingen? Sommige pakketten rekenen een vergoeding per gekoppelde rekening:

  • InformerOnline: €1 per rekening per maand. Voor koppelingen via Ponto geldt €4 per maand.
  • Silvasoft: €4 per gekoppelde bankrekening per maand via Ponto.
  • Rompslomp: €3 per extra bankkoppeling buiten het pakket.
  • Visma eAccounting: €2,25 voor extra bankverbindingen.
  • e-Boekhouden.nl: €0,99 per maand voor Knab.

Welke factuurlimieten gelden? Exact Online Boekhouden Plus heeft een maximum van 100 verkoopfacturen per maand. Ga je daaroverheen, dan heeft dat gevolgen voor je licentie.

Wat kosten extra administraties en gebruikers?

  • InformerOnline: €10 per extra administratie en €10 per extra gebruiker.
  • Exact Online: €20 per extra administratie en €23 per extra gebruiker.

Hoe voldoe je bij overstappen aan bewaarplichten?

Wanneer bewaar je gegevens 7 of 10 jaar? Je bent wettelijk verplicht je bedrijfsadministratie minimaal 7 jaar te bewaren. Voor transacties onder de Unie-OSS- of IOSS-regeling voor leveringen binnen de EU geldt een bewaartermijn van 10 jaar na het jaar van levering.

Welke bestanden neem je mee bij een overstap? Een auditfile, zoals een XAF- of XML-bestand, bevat boekingen en saldo-informatie. Dit bestand vormt op zichzelf niet je volledige administratie. Bij een overstap naar een ander boekhoudpakket moet je de volgende bronbestanden veiligstellen:

  • Originele verkoopfacturen en creditnota's in pdf of een ander digitaal formaat.
  • Overzichten die laten zien hoe je betalingen aan facturen hebt gekoppeld, plus uitbetalingsoverzichten van je PSP. Denk aan Mollie-specificaties, inclusief transactie-ID's.
  • Inkoopfacturen, bonnetjes en bankafschriften.

Exporteer deze oude gegevens voordat je je boekhoudabonnement opzegt. Bewaar ze lokaal of in een beveiligd archief.

Hoe werk je samen met je boekhouder?

Wie doet welke werkzaamheden? Je kunt de werkzaamheden voor je webshop verdelen. Je zorgt zelf voor de dagelijkse invoer via automatische webshop- en bankkoppelingen. Je boekhouder of accountant houdt toezicht op de fiscale verwerking, complexe retouren en de jaarafsluiting.

Hoe krijgt je adviseur toegang? De meeste systemen ondersteunen directe samenwerking met een externe adviseur zonder dat dit ten koste gaat van je eigen licenties:

  • Gratis toegang: bij onder meer e-Boekhouden.nl, Silvasoft en SnelStart kan je accountant gratis meekijken en meewerken in je online administratie.
  • Eigen licentie: bij Exact Online koppelt je accountant de eigen licentie aan je administratie.
  • Exportbestanden: software zoals Moneybird, InformerOnline en Visma eAccounting ondersteunt auditfiles en gestructureerde exports. Een voorbeeld is de RGS-brug, een bestand om boekhoudgegevens uit te wisselen. Daarmee kan je adviseur gegevens direct inlezen in professionele rapportage- en aangiftesoftware.

Spreek vooraf af wie de tussenrekeningen van je PSP controleert: de rekeningen waarop betalingen tijdelijk staan. Leg ook vast wie de btw-aangiftes en eventuele OSS-aangiftes verstuurt.

Veelgemaakte fouten bij boekhoudsoftware voor webshops

1
Netto-uitbetalingen van je PSP als omzet boekenEen uitbetaling van je betaalprovider (PSP), zoals Mollie, is niet je omzet: transactiekosten en eventuele terugboekingen of terugbetalingen zijn al verrekend, waardoor je met alleen het nettobedrag een onjuiste omzet boekt en aftrekbare kosten mist. Importeer orders voor het brutobedrag en boek transactiekosten apart; bij Moneybird kan de software externe facturen alleen automatisch aan betalingen koppelen als je webshopkoppeling het specifieke Mollie-transactie-ID correct meestuurt.
2
Een retour alleen als bankafschrijving boekenAlleen de bankafschrijving boeken is niet voldoende: volgens de Belastingdienst moet je met een officiële creditfactuur zowel omzet als btw corrigeren in het tijdvak van de teruggaaf, via negatieve omzet en btw in rubriek 1a of 1b. Vertrouw niet op automatische verwerking door je webshopkoppeling en test vooraf deelterugbetalingen of laat je boekhouder meekijken; bij InformerOnline moet je gedeeltelijke creditbedragen handmatig afboeken.
3
Btw-drempels voor KOR, afstandsverkopen en EU-KOR verwarrenDe Nederlandse KOR geldt tot maximaal €20.000 jaaromzet; verkopen aan consumenten in andere EU-landen en de EU-KOR hebben elk een eigen omzetgrens. Controleer je omzet regelmatig: de Nederlandse KOR-vrijstelling vervalt direct vanaf de transactie waarmee je de grens overschrijdt.
4
Een directe btw-aangifte verwarren met een OSS-meldingVeel pakketten bieden directe btw-aangifte, maar die geldt alleen voor de Nederlandse omzetbelasting: voor internationale verkopen via de Unieregeling (OSS) moet je ieder kwartaal een aparte OSS-melding doen. Jortt maakt hiervoor een rapport, maar dient dit niet als reguliere btw-aangifte in; controleer of je de OSS-cijfers apart kunt exporteren of dat je accountant de kwartaalaangifte handmatig moet indienen.
5
Automatisch voorraadbeheer en retourverwerking verwachten van orderkoppelingenEen WooCommerce- of Shopify-koppeling importeert meestal verkooporders, maar werkt voorraad en retouren zelden volledig in beide systemen bij: Moneybird is niet geschikt voor automatische voorraadadministratie, Visma eAccounting Voorraad koppelt inkomende goederen niet aan inkoopfacturen en Rompslomp beschrijft retouren terugboeken als handwerk. Bepaal of je de actuele voorraad in je webshop bijhoudt of investeert in een voorraadmodule, zoals Silvasoft Product- & voorraadbeheer voor €7,95 per maand extra excl. btw.
6
De bewaartermijn van 7 of 10 jaar onderschattenVoor je gewone bedrijfsadministratie geldt een bewaarplicht van 7 jaar, maar gegevens over buitenlandse verkopen onder OSS of IOSS moet je 10 jaar na het jaar van levering bewaren. Een XML-auditfile of beperkte back-up bevat niet altijd de volledige administratie: archiveer daarom zelf je brondocumenten, zoals externe verkoopfacturen, PSP-afschriften en logbestanden van koppelingen, voordat je overstapt.

Checklist: welk boekhoudprogramma past bij jouw webshop?

Een boekhoudprogramma voor je webshop moet meer kunnen dan facturen versturen. Gebruik deze checklist van 11 vragen om te bepalen wat je kunt automatiseren, welke extra kosten je betaalt en wanneer je je boekhouder moet inschakelen.

0 van 11 afgevinkt · automatisch lokaal bewaard

Veelgestelde vragen over boekhoudsoftware voor webshops

Is een betaalkoppeling met je betaalprovider hetzelfde als automatisch afletteren?
Nee, een betaalknop op je factuur of betaalpagina laat je klant alleen betalen; automatisch afletteren betekent dat de software verzameluitbetalingen van je betaalprovider, zoals Mollie, aan openstaande webshoporders koppelt, inclusief transactiekosten en eventuele terugboekingen of terugbetalingen. Bij Moneybird werkt dit alleen als je webshopkoppeling het specifieke Mollie-transactiekenmerk correct meestuurt. Vraag dit vooraf na bij de leverancier van je koppeling om handmatig zoekwerk te voorkomen.
Verwerkt een webshopkoppeling retouren en creditfacturen automatisch in de boekhouding?
Niet altijd: veel koppelingen importeren nieuwe bestellingen, maar verwerken retouren en terugbetalingen onvolledig of niet automatisch. Je moet bij een retour zowel de omzet als de afgedragen btw corrigeren via negatieve omzet in rubriek 1a of 1b; alleen een negatieve bank- of PSP-transactie boeken is niet genoeg. Bij Rompslomp en InformerOnline moet je gedeeltelijke crediteringen en voorraadcorrecties handmatig boeken, dus controleer tijdens de testperiode hoe je koppeling omgaat met gedeeltelijke retouren en het terugzetten in de voorraad.
Kan ik mijn voorraadbeheer volledig in het boekhoudprogramma onderbrengen?
Dat hangt af van het pakket: Silvasoft Product- & voorraadbeheer biedt aantallen- en inkoopadministratie voor €7,95 per maand extra excl. btw; Visma eAccounting Voorraad kost €12 per maand excl. btw, maar koppelt inkomende goederen niet direct aan inkoopfacturen. Moneybird en Jortt hebben bewust geen voorraadmodule en registreren alleen financiële voorraadwaarden; ook Exact Online Boekhouden Plus voor €99 per maand excl. btw bevat geen beheer van de actuele voorraad en verwijst daarvoor naar aparte handelsmodules. Bepaal vooraf of je de voorraad in je webshop, zoals Shopify of WooCommerce, laat staan of in je boekhouding wilt beheren.
Welke kosten komen boven op mijn boekhoudabonnement?
Je abonnement dekt zelden de volledige kosten: reken op externe koppeldiensten, bankkoppelingen en aparte voorraad- of handelsmodules. Voorbeelden zijn Webwinkelfacturen, een SnelStart-koppeling vanaf €15 per maand plus €250 eenmalige inrichting excl. btw, Ponto bij Silvasoft voor circa €4 per maand per rekening en Knab bij e-Boekhouden.nl voor €0,99 per maand. Vraag alle tarieven van externe koppeldiensten op voordat je definitief kiest.
Verzendt de software mijn OSS-aangifte voor buitenlandse verkopen automatisch?
Nee, directe btw-aangifte vanuit boekhoudsoftware gaat vrijwel altijd over Nederlandse omzetbelasting, niet over de Unieregeling (OSS); Jortt maakt wel een OSS-overzicht, maar je dient dit zelf handmatig in via het Belastingdienst-portaal. Verkoop je per kalenderjaar voor meer dan €10.000 aan particulieren in andere EU-landen, dan moet je buitenlandse btw berekenen en die ieder kwartaal via het OSS-portaal opgeven. Verwar deze drempel niet met de Nederlandse KOR-grens van €20.000 of de EU-KOR-grens van €100.000.
Hoe lang moet ik de administratie van mijn webshop bewaren?
Voor je gewone Nederlandse administratie geldt een wettelijke bewaarplicht van 7 jaar. Voor verkopen binnen de EU onder de Unieregeling (OSS) of IOSS moet je de bijbehorende documenten en transactiegegevens 10 jaar na het jaar van levering bewaren. Een XML-auditfile bewaart niet automatisch alle pakbonnen, PSP-specificaties en webshoporders: maak daarom bij overstappen of stoppen een volledige export van je facturen, logbestanden van koppelingen en betalingsbewijzen.
Moet ik als webshopondernemer e-facturen via Peppol versturen?
Nee, er geldt op dit moment geen algemene verplichting voor webshops om facturen via Peppol, een netwerk voor elektronische facturen, naar consumenten (B2C) of gewone bedrijven (B2B) te versturen. Die verplichting geldt momenteel alleen bij leveringen aan de Rijksoverheid.
Kan ik de belastingaangiftes en jaarstukken van mijn webshop zelf afronden?
Met een eenmanszaak kun je de winst uit je winst-en-verliesrekening en balans direct overnemen in je aangifte inkomstenbelasting; met een bv moet je aangifte vennootschapsbelasting (VPB) doen en de jaarrekening bij KVK deponeren. e-Boekhouden.nl, Moneybird en Visma eAccounting dienen wel btw-aangiftes in, maar verzorgen geen wettelijke deponering van de jaarrekening of VPB-aangifte. Heb je een bv of complexe internationale omzet, dan is controle door een accountant of boekhouder sterk aan te raden.

Zo vergelijken we boekhoudpakketten

We beoordelen elk pakket op vaste criteria met vaste gewichten, waarbij geschiktheid voor het scenario het zwaarst weegt; de ranking staat los van eventuele commerciële relaties.

Geschiktheid voor het scenario
20 pt
Totale geschatte kosten
18 pt
Kernfuncties (facturen, btw, bank)
13 pt
Koppelingen en export
12 pt
Aangiftes (btw/ICP)
10 pt
Gebruiksgemak
9 pt
Schaalbaarheid
8 pt
Support
6 pt
Belangrijkste beperking (aftrek)
4 pt
Onderzocht in deze vergelijking
9 aanbieders onderzocht met openbaar controleerbare tarieven
Tarieven gecontroleerd op peildatum 2 oktober 2026, via openbare prijspagina's
Geschatte kosten berekend per scenario; de kostenmodule toont per aanbieder wat wel en niet is meegerekend
Welke aanbieders zijn onderzocht
Aanbieders die actief in Nederland worden aangeboden aan zzp'ers en kleine bedrijven.
Zowel grote gevestigde pakketten als nieuwere toetreders komen aan bod.
We nemen alleen aanbieders op met openbaar controleerbare tarieven.
Hoe geschatte kosten worden berekend
We gebruiken de laagste, gemiddelde en hoogste pakketten per aanbieder als bandbreedte.
Kosten zijn exclusief btw en gebaseerd op de meest recente openbare prijslijst.
Extra gebruikers, koppelingen en transactiekosten worden waar bekend meegenomen.
Hoe commerciële relaties worden behandeld
Commerciële relaties met aanbieders worden vermeld, maar beïnvloeden de ranking niet.
De volgorde van aanbieders is gebaseerd op de vaste weegcriteria hierboven.
Eventuele vergoedingen wijzigen niets aan de score of tekst per aanbieder.
Fouten melden en correcties
Zie je een fout of verouderd tarief? Meld dit via onze contactpagina.
Onderbouwde correcties verwerken we met bronvermelding.
Aanbieders hebben geen redactioneel veto over de inhoud.

Doorlopend onderzoek

We onderhouden een aantal doorlopende onderzoeksprogramma's om deze pagina actueel te houden.

LOOPT

Kostenindex boekhoudsoftware

Maandelijkse controle van openbare tarieven en pakketwijzigingen per aanbieder.

LOOPT

Koppelingen-monitor (banken & tools)

Doorlopende inventarisatie van bankkoppelingen en integraties per pakket.

IN OPBOUW

Aangifte-doorlooptijden

Onderzoek naar hoe snel en soepel btw-aangiftes via elk pakket verlopen.

IN OPBOUW

Supportkwaliteit per aanbieder

Vergelijkend onderzoek naar responstijd en kwaliteit van klantenservice.

Zo controleerden we dit artikel

We controleren tarieven en voorwaarden en werken de pagina bij zodra prijzen, pakketten of beleid veranderen.

Beoordeeld door: Boekhouder.nl Research TeamPrijspeildatum: 27 juli 2026
  1. Huidige versie

    18 okt 2026

    Bijgewerkt door

    Boekhouder.nl Research Team · Pagina bijgewerkt.

  2. 20 jul 2026

    Geschreven door

    Boekhouder.nl Research Team · Pagina gepubliceerd.