Boekhouder.nl
Webshop & e-commerce

Onafhankelijk vergeleken op orderkoppelingen, PSP-aflettering en btw

Facturatieprogramma voor je webshop vergelijken

Je wilt webshopbestellingen direct omzetten in kloppende facturen, zonder extra administratie. Daarvoor zoek je automatische orderverwerking, betalingen koppelen aan facturen via je betaalprovider (PSP) of een directe boekhoudkoppeling.

Welk pakket past, hangt af van je aantal orders en retouren, platformverkopen en buitenlandse btw via het éénloketsysteem (OSS). Ook je boekhouding telt mee: wil je alles in één administratie of een koppeling met het pakket van je boekhouder?

Start de keuzehulp voor advies dat past bij je webshop, of bekijk direct de vergelijking hieronder.

SNEL ANTWOORD PER SITUATIEBekijk uitleg
Webshop en boekhouding samen
e-Boekhouden.nl
Koppeling met externe boekhouding
WeFact
Betaalprovider en retouren afletteren
Jortt
Facturen per document verwerken
Billit
Zo is deze pagina gemaakt:
  • Koppelingen voor o.a. Shopify, WooCommerce en bol gecontroleerd
  • Getoetst op uitsplitsing van PSP-kosten, restituties en uitbetalingen
  • Inzicht in creditnota's bij retouren en grensoverschrijdende OSS-btw
  • Onderscheid tussen eigen boekhouding en koppeling met je accountant
Onderzoek en redactie
Boekhouder.nl Research Team
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026
Commerciële relaties: worden vermeld
Bekijk methodologie
Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria. Lees hoe wij vergelijken en geld verdienen
Expert take
BR

Boekhouder.nl Research Team

Redactie zakelijke software en diensten

“De beste keuze is een facturatieprogramma die past bij hoe jij werkt, niet de aanbieder met de laagste maandprijs.”

Mijn advies: Reken door met je eigen volume: de kosten die met je gebruik meelopen maken een goedkoop pakket snel duurder dan een duurder pakket waarin ze inbegrepen zijn. Controleer daarnaast of de aanbieder koppelt met de software die je al gebruikt, en welke gegevens je meeneemt als je later overstapt.

In het kort

Je keuze hangt vooral af van je verkoopkanalen en de aansluiting op je boekhouding.

  • e-Boekhouden.nl past meestal bij een complete webshopadministratie, vanaf €24 per maand. Het verwerkt orders direct en lettert betalingen via je betaalprovider automatisch af: het koppelt betalingen aan facturen.
  • Jortt past meestal bij een complete webshopadministratie, vanaf €29,95 per maand. Ook dit pakket verwerkt orders direct en lettert betalingen via je betaalprovider automatisch af.
  • WeFact past als je de bestaande boekhouding van je accountant wilt behouden en alleen facturen wilt doorsturen. Het is beschikbaar vanaf €16,50 per maand.
  • Verkoop over de grens of via platforms zoals bol? Controleer vooraf hoe het pakket retouren, creditnota's en buitenlandse btw via het éénloketsysteem (OSS) verwerkt. Een creditnota corrigeert een eerdere factuur.

Bron: openbare tarieven, peildatum 2 oktober 2026

Op deze pagina22 onderdelen

Kies het juiste facturatieprogramma voor jouw webshop

Welke software past, hangt af van je webshopkoppeling, de verwerking van betalingen en de samenwerking met je boekhouder. Kies de situatie die aansluit bij je webshop.

Keuzehulp facturatiesoftware voor je webshop

Beantwoord enkele korte vragen en krijg twee tot vier aanbieders te zien, met uitleg waarom ze passen, een kostenindicatie en wat je nog moet controleren. Je hebt geen e-mailadres nodig; je antwoorden blijven alleen lokaal bewaard.

1. Wat is jouw situatie als webshophouder?Kies wat het beste aansluit bij je webwinkel
2. Hoeveel bestellingen verwerk je per maand?Een schatting is genoeg
3. Wat vind je het belangrijkst?Kies maximaal 3 prioriteiten
4. Wat gebruik je op dit moment?Kies wat het meest van toepassing is

Beantwoord minimaal vraag 1 t/m 3

Facturatieprogramma’s vergeleken

Per aanbieder zie je waar die het best bij past, wat die ongeveer kost en wat de belangrijkste beperking is. "Beste voor" zegt iets over geschiktheid — niet over commissie.

Beste voor boekhouden en webshop samen

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van e-Boekhouden.nl
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Eerste 15 maanden gratis voor startende ondernemersKosteloze toegang voor je accountant of boekhouderDirecte btw-aangifte en opgaaf ICP naar de BelastingdienstIngebouwde urenregistratie en mobiele app voor bonnetjes scannen

Waarom aanbevolen: Dit pakket past bij je als je als zzp'er of mkb-ondernemer zelfstandig je administratie wilt bijhouden zonder ingewikkelde boekhoudkennis. Je verwerkt je inkomsten en uitgaven snel in een overzichtelijke omgeving en werkt eenvoudig samen met je boekhouder.

Minder geschikt als: je een Engelstalige werkomgeving zoekt of veel transacties hebt, waardoor je vastloopt op ontbrekende vertalingen en het transactieplafond van het instappakket.

Belangrijkste beperking: Het ZZP-pakket stopt bij 240 boekingen per jaar; controleer je transactievolume om een onverwachte prijsverhoging te voorkomen.

Standaard + Factureren

€24/maandOnbeperkt boekhouden en factureren, extra gebruikers gratis, Scan & Herken vanaf €0,09 per credit

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€24/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: Standaard + Factureren

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor koppeling met je boekhouder

WeFact

Facturatiesoftware

Geen partner

Bron: review van WeFact
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Ondersteuning voor e-facturatie via Peppol en UBL 2.1Automatische herinneringen en aanmaningen via e-mail of PeppolOnline betaallinks via Mollie direct op facturen en herinneringenMobiele app voor iOS en Android inclusief bonnenscanner

Waarom aanbevolen: Als je als ondernemer zelf offertes, periodieke facturen en betalingsherinneringen wilt automatiseren, sluit WeFact goed aan op je werkproces. Je verstuurt eenvoudig facturen via e-mail of Peppol en laat klanten direct afrekenen via een betaallink.

Minder geschikt als: je een compleet boekhoudpakket zoekt voor de btw-aangifte, waardoor je verplicht bent om een extern boekhoudprogramma te koppelen.

Belangrijkste beperking: Het btw-overzicht is slechts indicatief; controleer het met je boekhouder of koppel een extern boekhoudpakket voor je aangifte.

Start 100

€17,25/maand100 facturen/maand inbegrepen, onbeperkt aantal gebruikers, €0,32 per iDEAL-transactie

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€17,25/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: Start 100

Geen commerciële relatie. Je bewaart deze aanbieder in je routekaart en gaat daarna zelf naar de aanbieder.

Beste voor verkopen via meerdere platforms

Jortt

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van Jortt
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Directe elektronische btw-aangifte naar de BelastingdienstFacturen en offertes digitaal versturen en ontvangen via PeppolAutomatische boekhoudbot met ruim 1.170 ingebouwde boekingsregelsKoppeling met Nederlandse banken en automatische transactie-import

Waarom aanbevolen: Jortt past bij je als je zonder boekhoudkennis je administratie grotendeels wilt automatiseren via je banktransacties. De automatische boekhoudbot verwerkt het meeste werk zelfstandig, waardoor je btw-aangifte doorlopend klaarstaat.

Minder geschikt als: je samenwerkt met een traditionele boekhouder die grootboekkaarten in Excel vereist, waardoor de samenwerking stroef verloopt.

Belangrijkste beperking: Na opzeggen verwijdert Jortt je gegevens na 30 dagen — download daarom vooraf je fiscale bewaarbestanden.

Jortt MKB

€29,95/maandof €335,40/jaar; maximaal 5 gebruikers en onbeperkt bankkoppelingen

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€29,95/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: Jortt MKB

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor samenwerken in dezelfde administratie

SnelStart

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van SnelStart
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Gratis automatische bankkoppeling via PSD2 voor Nederlandse grootbankenAutomatische scan en herken van bonnetjes en inkoopfacturen inbegrepenBtw-aangifte direct indienen via Digipoort zonder eHerkenning vanaf inKaartE-facturen veilig verzenden en ontvangen via het Peppol-netwerk

Waarom aanbevolen: SnelStart past bij ondernemers die eenvoudig online willen boekhouden en nauw willen samenwerken met hun boekhouder. Je accountant kijkt gratis mee in dezelfde administratie, waardoor de btw-aangifte en de jaarafsluiting soepel verlopen.

Minder geschikt als: je tweedehands auto's verkoopt onder de margeregeling, omdat SnelStart geen individuele marge-administratie ondersteunt en je daar externe software voor nodig hebt.

Belangrijkste beperking: SnelStart Web ondersteunt geen directe Excel-exports van klanten of grootboeken; controleer of je de Windows-desktopversie kunt installeren.

inKaart

€22/maand1 gebruiker en 1 administratie inbegrepen, daarna €4,25 per extra gebruiker/maand en €3,50 per extra administratie/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€22/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: inKaart

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor facturen digitaal doorsturen

Billit

Facturatiesoftware

Geen partner

Bron: review van Billit
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Inclusief gratis Peppol Access Point en automatische KvK-bedrijfsgegevenscontroleBetaallinks en QR-codes op facturen via directe Mollie-koppelingIngebouwde urenregistratie die je direct omzet naar conceptfacturenGratis dossier-toegang voor je externe boekhouder of accountant

Waarom aanbevolen: Als je veel facturen digitaal wilt versturen via het Peppol-netwerk en offertes direct online wilt laten ondertekenen, sluit Billit goed aan. Je koppelt verkoopfacturen en banktransacties eenvoudig door naar het externe boekhoudpakket van je accountant.

Minder geschikt als: je een compleet zelfstandig boekhoudprogramma zoekt, waardoor je alsnog aparte software of een accountant nodig hebt voor je belastingaangiftes.

Belangrijkste beperking: Een lager pakket kan alleen bij maandverbruik onder die pakketlimiet; controleer je verbruik van de voorgaande maand.

Starter

€7,50/maand25 documenten en 1 gebruiker inbegrepen, daarna €0,50 per extra document en €5 per extra gebruiker/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€7,50/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: Starter

Geen commerciële relatie. Je bewaart deze aanbieder in je routekaart en gaat daarna zelf naar de aanbieder.

Beste voor offertes snel omzetten

Moneybird

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van Moneybird
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Ingebouwde urenregistratie met controle op het urencriterium van 1.225 uurDirecte btw- en ICP-aangifte indienen bij de Belastingdienst vanaf het Start-pakketKosteloos facturen versturen en ontvangen via het Peppol-netwerkOffertes digitaal laten ondertekenen door klanten inclusief optionele keuzeregels

Waarom aanbevolen: Als ondernemer die vlot offertes en verkoopfacturen wil versturen, past Moneybird goed bij je werkwijze. Je zet geaccepteerde offertes direct om in facturen en hebt dankzij ingebouwde urenregistratie meteen overzicht over je opdrachten.

Minder geschikt als: je veel banktransacties verwerkt of telefonische hulp zoekt, waardoor je gedwongen wordt naar een duurder pakket en bij problemen moet wachten op e-mail of chat.

Belangrijkste beperking: Boven de transactielimiet blokkeert de invoer direct; controleer je maandelijkse transacties om dure overstappen naar hogere pakketten te voorkomen.

Groei

€35/maand50 banktransacties, 5 gebruikers en 5 externe bankkoppelingen inbegrepen. €0,29 per iDEAL-transactie

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€35/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: Groei

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Beste voor zelf btw-aangifte doen

InformerOnline

Online boekhoudsoftware

Commerciële partner

Bron: review van InformerOnline
Laatst gecontroleerd: 2 oktober 2026

Directe btw-aangifte naar de Belastingdienst met betaling via iDEAL of WeroMobiele app voor iOS en Android met urenregistratie en AI-spraaksturingGratis meekijkportaal voor je accountant of boekhouderExport van RGS-brugstaat voor inkomstenbelastingaangifte via Nextens

Waarom aanbevolen: InformerOnline past bij je als je zelfstandig je administratie wilt bijhouden en direct btw-aangifte wilt doen zonder eHerkenning. Je verwerkt je facturen en bonnetjes snel via een webomgeving of mobiele app, met ondersteuning via een actieve live-chat.

Minder geschikt als: je telefonische ondersteuning zoekt bij complexe fiscale vraagstukken, waardoor je bent aangewezen op de live-chat of duurdere externe hulp.

Belangrijkste beperking: Bankkoppelingen kosten minimaal €1 per rekening per maand extra; controleer vooraf je bank en totale kosten.

ZZP Plus

€23/maandOnbeperkt banktransacties, 50 scans/maand inbegrepen, daarna €0,15 per scan, bankkoppeling €1 per rekening/maand

GESCHAT BIJ JOUW SCENARIO

€23/maand

Scenario: Startende webshop · 25 facturen p/m

Aanbevolen pakket: ZZP Plus

Bekijk

Mogelijk ontvangen wij een vergoeding. Dit beïnvloedt de beoordeling niet.

Wat kost een facturatieprogramma voor je webshop echt?

De maandprijs is maar een deel van het verhaal. De totale kosten hangen af van je gebruik.

Totale kosten = de maandprijs van het pakket + de kosten die met je gebruik meelopen (per factuur of per gebruiker) + eenmalige kosten voor implementatie of import van je klantgegevens.
Kies een scenario:
e-Boekhouden.nlOnline boekhoudsoftware
Per maand€24/maand
Aanbevolen pakket: Standaard + Factureren · Onbeperkt boekhouden en factureren, extra gebruikers gratis, Scan & Herken vanaf €0,09 per credit
Bekijk
WeFactFacturatiesoftware
Per maand€17,25/maand
Aanbevolen pakket: Start 100 · 100 facturen/maand inbegrepen, onbeperkt aantal gebruikers, €0,32 per iDEAL-transactie · €17,25/maand plus €0,32 per transactie. Dit scenario rekent met 25 facturen; reken door met het aantal transacties dat je nodig hebt.
JorttOnline boekhoudsoftware
Per maand€29,95/maand
Aanbevolen pakket: Jortt MKB · of €335,40/jaar; maximaal 5 gebruikers en onbeperkt bankkoppelingen
Bekijk
SnelStartOnline boekhoudsoftware
Per maand€22/maand
Aanbevolen pakket: inKaart · 1 gebruiker en 1 administratie inbegrepen, daarna €4,25 per extra gebruiker/maand en €3,50 per extra administratie/maand · €22/maand plus €4,25 per gebruiker. Dit scenario rekent met 25 facturen; reken door met het aantal gebruikers dat je nodig hebt.
Bekijk
BillitFacturatiesoftware
Per maand€7,50/maand
Aanbevolen pakket: Starter · 25 documenten en 1 gebruiker inbegrepen, daarna €0,50 per extra document en €5 per extra gebruiker/maand · €7,50/maand dekt 25 facturen per maand, dus bij 25 betaal je niets bij.
MoneybirdOnline boekhoudsoftware
Per maand€35/maand
Aanbevolen pakket: Groei · 50 banktransacties, 5 gebruikers en 5 externe bankkoppelingen inbegrepen. €0,29 per iDEAL-transactie · €35/maand plus €0,29 per transactie. Dit scenario rekent met 25 facturen; reken door met het aantal transacties dat je nodig hebt.
Bekijk
InformerOnlineOnline boekhoudsoftware
Per maand€23/maand
Aanbevolen pakket: ZZP Plus · Onbeperkt banktransacties, 50 scans/maand inbegrepen, daarna €0,15 per scan, bankkoppeling €1 per rekening/maand
Bekijk
RompslompOnline boekhoudsoftware
Per maand€26,50/maand
Aanbevolen pakket: Professional · 1 bankkoppeling, 1 administratie en 2 gebruikers inbegrepen, daarna €3 per extra gebruiker/maand, €3 per extra bankkoppeling/maand en €10 per extra administratie/maand · €26,50/maand plus €3 per gebruiker. Dit scenario rekent met 25 facturen; reken door met het aantal gebruikers dat je nodig hebt.
Bekijk

Dit is een bandbreedte op basis van openbare tarieven (peildatum 2 oktober 2026), excl. btw. Werkelijke kosten hangen af van je gebruik.

Vergelijk facturatieprogramma’s

Bekijk de belangrijkste verschillen tussen aanbieders naast elkaar.

Pakketten (3/4):

Veeg opzij om alle pakketten te zien.

Kenmerk

e-Boekhouden.nl

Online boekhoudsoftware

WeFact

Facturatiesoftware

Jortt

Online boekhoudsoftware

Beste voorboekhouden en webshop samenkoppeling met je boekhouderverkopen via meerdere platforms
Geschatte maandkosten€24/maand€17,25/maand€29,95/maand
InstappakketStandaard + Factureren · €24/maandStart 100 · €17,25/maandJortt MKB · €29,95/maand
WebshopkoppelingKoppelt direct met WooCommerce; Shopify via externe partners.Koppelt via integraties met onder meer Shopify en WooCommerce.Koppelt via Webwinkelfacturen en APIcenter met Shopify en WooCommerce.
BoekhoudkoppelingBevat een eigen compleet online boekhoudprogramma.Koppelt met Exact Online, Twinfield, SnelStart, Yuki en e-Boekhouden.Bevat een eigen compleet online boekhoudprogramma.
Betaalprovider-afletteringImporteert Mollie-transacties dagelijks via externe partner Pspbetalingen.nl.Synchroniseert Mollie-betaalstatus automatisch; verwerkt transactiekosten niet als boekhouding.Koppelt direct met Mollie en matcht betalingen automatisch.
Buitenlandse btw en OSS———
Belangrijkste beperkingHet ZZP-pakket stopt bij 240 boekingen per jaar; controleer je transactievolume om een onverwachte prijsverhoging te voorkomen.Het btw-overzicht is slechts indicatief; controleer het met je boekhouder of koppel een extern boekhoudpakket voor je aangifte.Na opzeggen verwijdert Jortt je gegevens na 30 dagen — download daarom vooraf je fiscale bewaarbestanden.
Laatst gecontroleerd2 oktober 20262 oktober 20262 oktober 2026
Volgende stapBekijkBekijk

Boekhouder.nl kan een vergoeding ontvangen wanneer je via een link een product kiest. Dit heeft geen invloed op onze beoordelingscriteria.

Hoe worden je webshoporders foutloos facturen?

Van bestelling naar verkoopfactuur

Je wilt bestellingen niet handmatig overtikken. Daarvoor heb je een koppeling nodig die orders uit bijvoorbeeld Shopify of WooCommerce automatisch omzet in een verkoopboeking of factuur.

Let op hoe de koppeling werkt. Sommige pakketten, zoals e-Boekhouden.nl, bieden een directe gratis koppeling voor WooCommerce. Bij andere systemen, zoals InformerOnline, Rompslomp of SnelStart, loopt de koppeling vaak via een externe partner zoals Webwinkelfacturen.nl.

Welke regels gelden voor je facturen?

Voor de Belastingdienst moeten je factuurnummers binnen je gekozen reeks altijd op elkaar volgen en uniek zijn. Elk factuurnummer mag maar één keer voorkomen.

Verkoop je uitsluitend aan particulieren (B2C)? Dan hoef je volgens de btw-regels niet altijd voor elke consumentenorder een officiële btw-factuur uit te reiken. Je moet de bestelgegevens wel volledig en sluitend vastleggen in je administratie. Zo blijft je omzet controleerbaar.

Hoe verwerk je uitbetalingen van je betaalprovider?

Wat doet een koppeling naast een betaallink?

Een betaallink op een factuur is iets anders dan webshopontvangsten automatisch afletteren. Een volledige koppeling met een betaalprovider (PSP) zoals Mollie verwerkt losse betalingen, ingehouden transactiekosten en gebundelde uitbetalingen apart.

Jortt heeft een ingebouwde werkwijze die losse betalingen, Mollie-inhoudingen en bankuitbetalingen direct tegen elkaar wegstreept. Jortt rekent zelf geen extra kosten voor de Mollie-koppeling.

Welk betaalkenmerk moet je koppeling meesturen?

Bij systemen zoals Moneybird werkt automatische aflettering van Mollie-uitbetalingen alleen als de externe webshopkoppeling het specifieke Mollie-transactiekenmerk (`tr_`) meestuurt. Ontbreekt dat kenmerk in de bestelgegevens? Dan moet je betalingen alsnog handmatig controleren.

Bij SnelStart kun je voor inKaart een aparte Mollie-koppeling via partner S for Software gebruiken. Die kost €20 per maand. De koppeling boekt de kosten apart en verwerkt transacties via een tussenrekening voor bedragen die onderweg zijn tussen rekeningen (kruisposten).

Hoe boek je retouren en terugbetalingen?

Terugbetalen is nog geen administratieve correctie

Consumenten hebben bij aankopen op afstand wettelijk recht op 14 dagen bedenktijd. Je kunt een bedrag snel terugstorten via je betaalprovider. Daarmee is je boekhouding nog niet aangepast.

Bij een retourzending hoort in je administratie een creditfactuur of een negatieve correctieboeking. Daarmee verlaag je de verschuldigde btw en corrigeer je de geboekte omzet.

Wat gebeurt er bij deelretouren en voorraadbeheer?

Stuurt je klant een deel van de bestelling terug? Dan moet de correctie precies aansluiten op de teruggestuurde artikelen en het juiste btw-tarief. Bij Jortt moet je correcties met buitenlandse btw of verlegde btw deels handmatig invoeren. Bij verlegde btw draagt de klant de btw af.

Let ook op de grenzen van je facturatiesoftware. Programma's zoals Jortt en Moneybird hebben geen geautomatiseerde voorraadmodule. Een financiële correctie past dus niet automatisch je magazijnvoorraad of herbevoorrading aan.

Hoe verwerk je buitenlandse btw via OSS?

De drempel van €10.000 voor EU-verkopen

Verkoop je goederen aan consumenten in andere EU-landen? Dan geldt een gezamenlijke drempel van €10.000 per kalenderjaar voor alle EU-verkopen samen. De drempel geldt dus niet per land.

Boven deze drempel breng je het lokale btw-tarief van het land van de klant in rekening. Deze buitenlandse btw geef je ieder kwartaal aan via de Unieregeling binnen het One Stop Shop-systeem (OSS) van de Belastingdienst.

Maakt de software een rapport of aangifte?

Pakketten zoals Jortt Plus en Moneybird bieden een overzicht voor je OSS-aangifte. Daarin staan de omzet en btw apart per EU-lidstaat.

Geen enkel boekhoudpakket dient de OSS-aangifte rechtstreeks digitaal in bij de Belastingdienst. Neem de bedragen uit het rapport daarom zelf handmatig over in het online portaal van de Belastingdienst.

Hoe verwerk je platformverkopen, bijvoorbeeld via bol?

Wie draagt de btw af bij platformverkopen?

Verkoop je via platforms zoals bol of Amazon? Ga er dan niet zomaar van uit dat het platform de btw voor je afhandelt. Als verkoper blijf je zelf verantwoordelijk voor de btw-afdracht, tenzij de platformfictie geldt. Dat is een regel waarbij het platform voor de btw als leverancier geldt, bijvoorbeeld bij bepaalde invoerzendingen tot €150.

Je administratie moet de bruto verkoopopbrengst scheiden van de commissies en logistieke kosten die het platform inhoudt.

Hoe komen verkopen en commissies binnen?

Jortt heeft vanaf het Plus-pakket koppelingen om verkopen via bol te verwerken. Ook Billit biedt zulke koppelingen. Controleer vooraf hoe de software marktplaatsfacturen en commissieoverzichten inleest.

Je boekhouder moet kunnen controleren of verkopen als bruto omzet binnenkomen. De ingehouden platformcommissie moet daarbij apart als bedrijfskosten staan. Zo bereken je de omzetbelasting over het juiste totaalbedrag.

Welke kosten stijgen mee met je gebruik?

Wat betaal je per transactie of document?

Naast de vaste softwarekosten betaal je bij webshopverkopen vaak per transactie of document. Gebruik de kostenmodule hierboven om je situatie door te rekenen.

Let op deze kostenposten en limieten:

  • Betaalproviderkosten: je betaalt per betaling, bijvoorbeeld €0,32 per geslaagde iDEAL-transactie via Mollie bij WeFact.
  • Kosten per document: bij Billit betaal je bij een abonnement van 500 documenten €0,25 per extra factuur, creditnota of bonnetje.
  • Boekingslimieten: het ZZP Pakket van e-Boekhouden.nl heeft een maximum van 240 boekingen per boekjaar. Een groeiende webshop moet daardoor snel overstappen naar Standaard.
  • Externe koppelingen: partijen zoals Webwinkelfacturen.nl rekenen vaak een eigen maandtarief.
  • Aansluitkosten: voor een koppeling van WooCommerce of Shopify met SnelStart betaal je vanaf €15 per maand, plus eenmalig €250 aansluitkosten (excl. btw).
  • Extra bankkoppelingen bij InformerOnline: deze kosten €1 per maand.
  • Extra bankkoppelingen bij Rompslomp: deze kosten €3 per maand.
  • Scanherkenning: bij Informer betaal je bijvoorbeeld €0,15 per scan boven de 50 inbegrepen scans.

Alles in één pakket of je boekhouding koppelen?

Alles in één of aparte facturatiesoftware?

Voor je webshopadministratie kun je kiezen uit twee hoofdroutes:

  • Alles-in-één administratie: je gebruikt één systeem voor facturen, bank, btw-aangifte en jaarcijfers. e-Boekhouden.nl, Jortt en SnelStart werken zo.
  • Facturatiesoftware met boekhoudkoppeling: je gebruikt aparte facturatiesoftware voor je webshop. Die stuurt de facturen door naar het pakket van je accountant.

Kun je het pakket van je accountant behouden?

Wil je accountant in Exact Online, Twinfield of SnelStart blijven werken? Dan past WeFact als facturatieprogramma tussen je webshop en de boekhouding. WeFact koppelt je webshop aan deze externe boekhoudpakketten.

Voor een boekhoudkoppeling rekent WeFact €5 per maand. Werkt je accountant zelf met een WeFact-accountancyomgeving? Dan vervallen deze koppelingskosten.

Controleer vooraf met je boekhouder of creditnota's en betalingsstatussen foutloos over en weer worden bijgewerkt.

Wat neem je mee als je overstapt?

Fiscale bewaarplicht: 7 tot 10 jaar

Je bent wettelijk verplicht om je webshopadministratie minimaal 7 jaar in de originele vorm te bewaren. Gebruik je de OSS-regeling voor leveringen binnen de EU? Dan geldt voor die gegevens een bewaarplicht van 10 jaar.

Zeg je een facturatiepakket op? Dan verlies je na afloop van de contractperiode meestal toegang tot de online omgeving. Exporteer daarom op tijd al je verkoopfacturen, creditnota's en de complete auditfile: een exportbestand van je administratie voor je boekhouder.

Wat kun je meenemen bij een overstap?

Basisgegevens, zoals je klantenbestand en productcatalogus, neem je eenvoudig mee via een CSV- of Excel-import. Ook openstaande posten kun je overzetten als beginbalans in je nieuwe systeem.

Wat je vaker kwijtraakt, is de automatische koppeling tussen oude retouren en al afgesloten bestellingen. Stap daarom bij voorkeur over aan het begin van een nieuw boekjaar of kwartaal. Test de nieuwe webshop- en PSP-koppeling eerst grondig in een proefperiode, voordat je de oude definitief stopzet.

Veelgemaakte fouten bij facturatie voor webshops

1
Een betaallink verwarren met afletteringEen betaling ontvangen via je betaalprovider (PSP) is iets anders dan afletteren: betalingen aan facturen koppelen. Controleer vooraf of je koppeling ook transactiekosten, inhoudingen en uitbetalingen uitsplitst.
2
Verwachten dat een platform de btw regeltEen digitaal handelsplatform neemt je belastingplicht niet automatisch over. Controleer via welke partij de levering loopt en stem de juiste btw-afdracht af met je boekhouder.
3
Retouren alleen via je betaalprovider terugbetalenAlleen geld terugstorten bij een retour is niet genoeg voor je administratie. Maak altijd een bijbehorende creditfactuur aan om je omzet en btw-registratie correct aan te passen.
4
Verwachten dat de software je OSS-aangifte indientVeel systemen tonen buitenlandse btw-overzichten, maar dienen de One Stop Shop-aangifte (OSS) niet zelf in. Dien deze periodieke aangifte zelf in via het belastingportaal.
5
Het betaalkenmerk vergeten in de webshopkoppelingStuurt je webshopkoppeling het transactie-ID van de betaalprovider niet mee, dan lukt het niet om betalingen automatisch aan bestellingen te koppelen. Test vooraf of bestellingen en betalingen direct aan elkaar worden gekoppeld.
6
De bewaartermijn voor OSS-leveringen onderschattenVoor reguliere facturen geldt een bewaarplicht van zeven jaar, maar voor OSS-leveringen is dat tien jaar. Zorg dat je verkoopgegevens en correcties bij buitenlandse orders lang genoeg in je archief blijven.

Checklist: facturatie voor je webshop kiezen

Beantwoord deze vragen met ja of nee. Zo bepaal je welke eisen je webshop stelt aan de verwerking van orders, btw, retouren en betalingen.

0 van 11 afgevinkt · automatisch lokaal bewaard

Veelgestelde vragen over facturatie voor webshops

Moet je voor elke webshopbestelling een btw-factuur sturen?
Aan particuliere klanten hoef je volgens de belastingregels meestal geen officiële btw-factuur uit te reiken, zolang je de bestel- en betalingsgegevens sluitend vastlegt. Voor zakelijke klanten en buitenlandse leveringen binnen de EU is een correct genummerde factuur wel wettelijk verplicht. Vergelijk welke pakketten daarbij passen.
Hoe koppel je je webshop aan het pakket van je boekhouder?
Je kunt een apart facturatieprogramma zoals WeFact gebruiken om bestellingen om te zetten in facturen. Via een koppeling van €5 per maand stuurt WeFact deze door naar de boekhouding van je accountant. Zo behoudt je boekhouder het bestaande systeem en hoef je niet alles handmatig over te typen.
Waarom sluiten uitbetalingen van je betaalprovider niet aan op openstaande facturen?
Een betaalprovider (PSP) zoals Mollie bundelt betalingen en houdt daar direct transactiekosten of terugbetalingen op in. Je administratie heeft daarom een tussenrekening of speciale aflettermodule nodig om losse orders, kosten en netto uitbetalingen automatisch te splitsen. Vergelijk hoe de software dit verwerkt.
Hoe verwerk je retouren en terugbetalingen correct in je boekhouding?
Bij een retour moet je niet alleen geld terugbetalen, maar ook een creditfactuur maken om je omzet en afgedragen btw te corrigeren. Controleer of je webshopkoppeling die automatisch aanmaakt of dat je de correctie handmatig moet invoeren. Bereken de kosten voor je situatie.
Waar let je op bij buitenlandse verkopen en OSS?
Verkoop je jaarlijks voor meer dan €10.000 aan consumenten in andere EU-landen, dan bereken je het lokale btw-tarief van het bestemmingsland. Je doet hiervoor aangifte via het éénloketsysteem (OSS) van de Belastingdienst. Programma's zoals Jortt Plus bieden hiervoor aparte landenrapportages; vergelijk welk pakket bij je situatie past.
Welke kosten komen er bij je maandabonnement?
Naast je abonnement betaal je vaak apart voor externe koppelingen, zoals die van Webwinkelfacturen of specifieke koppelingen met betaalproviders van bijvoorbeeld €20 per maand. Sommige aanbieders rekenen ook kosten per gekoppelde bankrekening of verwerkt document. Bereken de kosten voor je situatie.
Hoelang moet je webshopfacturen en bestelgegevens bewaren?
Voor reguliere Nederlandse transacties moet je alle facturen en creditnota's 7 jaar bewaren. Gebruik je de Europese OSS-regeling voor leveringen aan buitenlandse consumenten, dan moet je deze gegevens wettelijk 10 jaar bewaren. Exporteer je gegevens op tijd als je overstapt.

Zo vergelijken we facturatieprogramma’s

We beoordelen elke aanbieder op vaste criteria met vaste gewichten, waarbij geschiktheid voor het scenario het zwaarst weegt; de ranking staat los van eventuele commerciële relaties.

Geschiktheid voor het scenario
20 pt
Totale geschatte kosten
18 pt
Functies die dit scenario nodig heeft
13 pt
Koppelingen en export
12 pt
Aansluiten en overstappen
10 pt
Gebruiksgemak app en dashboard
9 pt
Meegroeien: gebruikers en volume
8 pt
Support
6 pt
Belangrijkste beperking (aftrek)
4 pt
Onderzocht in deze vergelijking
8 aanbieders onderzocht met openbaar controleerbare tarieven
Tarieven gecontroleerd op peildatum 2 oktober 2026, via openbare prijspagina's
Geschatte kosten berekend per scenario; de kostenmodule toont per aanbieder wat wel en niet is meegerekend
Welke aanbieders zijn onderzocht
Aanbieders die een facturatieprogramma leveren aan ondernemers in Nederland.
We nemen alleen aanbieders op met openbaar controleerbare tarieven.
Aanbieders die de research voor dit scenario afwijst, staan met reden in de gids benoemd.
Hoe geschatte kosten worden berekend
We gebruiken de laagste, gemiddelde en hoogste pakketten per aanbieder als bandbreedte.
Kosten zijn exclusief btw en gebaseerd op de meest recente openbare prijslijst.
Kosten die met je gebruik meelopen nemen we mee waar de aanbieder ze publiceert.
Hoe commerciële relaties worden behandeld
Commerciële relaties met aanbieders worden vermeld, maar beïnvloeden de ranking niet.
De volgorde van aanbieders is gebaseerd op de vaste weegcriteria hierboven.
Eventuele vergoedingen wijzigen niets aan de score of tekst per aanbieder.
Fouten melden en correcties
Zie je een fout of verouderd tarief? Meld dit via onze contactpagina.
Onderbouwde correcties verwerken we met bronvermelding.
Aanbieders hebben geen redactioneel veto over de inhoud.

Doorlopend onderzoek

We onderhouden doorlopende onderzoeksprogramma’s om deze pagina actueel te houden.

LOOPT

Kostenindex facturatieprogramma’s

Maandelijkse controle van openbare tarieven en pakketwijzigingen per aanbieder.

LOOPT

Koppelingen-monitor

Doorlopende inventarisatie van koppelingen met boekhoudsoftware en exports per aanbieder.

IN OPBOUW

Supportkwaliteit per aanbieder

Vergelijkend onderzoek naar responstijd en kwaliteit van klantenservice.

Zo controleerden we dit artikel

We controleren tarieven en voorwaarden en werken de pagina bij zodra prijzen, pakketten of beleid veranderen.

  1. Huidige versie

    18 okt 2026

    Bijgewerkt door

    Boekhouder.nl Research Team · Pagina bijgewerkt.

  2. 10 sep 2026

    Geschreven door

    Boekhouder.nl Research Team · Pagina gepubliceerd.