Boekhouder.nl

Boekhoudprogramma voor reconciliatie kiezen

Verwerk je veel betalingen? Dan wil je bankmutaties automatisch koppelen aan facturen. Dat heet reconciliatie. Bij een webshop moeten ook orders, uitbetalingen en ingehouden kosten op elkaar aansluiten. Hier vergelijk je welke boekhoudprogramma’s bij jouw werkwijze passen. Let op pakketgrenzen, losse koppelingen en de betalingen die je zelf nog moet controleren.

Of kies een situatie:
In het kort
  • Van de 22 onderzochte boekhoudprogramma’s voldoen er 21 aan de eisen en is er 1 uitgesloten.
  • Kies op basis van je werk: bankmutaties verwerken, webshopbetalingen controleren of terugkerende facturen versturen.
  • Automatische matching en een auditfile bewijzen niet dat elke wijziging volledig wordt vastgelegd.
Uitgelichte partnersAdvertentieBetaalde plaatsing; de volgorde is geen onderzoeksranking en weegt niet mee in het advies hieronder. Hoe wij vergelijken en geld verdienen
e-Boekhouden.nlVanaf € 9,95 p/m · directe btw-aangifte, gratis accountantslicentieOnze bevindingen
MoneyMonkVanaf € 9 p/m · alle functies in elk pakket, 30 dagen gratis proberenOnze bevindingen
JorttGratis pakket, betaald vanaf € 19,95 p/m · 30 dagen gratis proberenOnze bevindingen
Persoonlijk advies van Boekhouder.nlAlgemene vergelijking

We vergelijken boekhoudsoftware op geschiktheid voor jouw situatie: prijs, pakketten, functies, bankkoppelingen, btw-ondersteuning, facturatie, boekhoudertoegang en beschikbare brondata — niet op populariteit of vergoeding. Commerciële relaties kunnen bestaan en worden vermeld. Aanbevelingen moeten passen bij de situatie van de gebruiker.

Gebaseerd op 54 bronnen, gecontroleerd op 23 oktober 2026.

Onderzoek en redactie
Boekhouder.nl Research Team
Inhoudelijk beoordeeld door
Remko Allertz
Software getest door
Shilpa Sitlani

Gepubliceerd 4 oktober 2026 · Pagina bijgewerkt 23 oktober 2026 · 54 bronnen gecontroleerd

Welk soort reconciliatie heb je nodig?

Kijk welke situatie aansluit bij je administratie. De genoemde pakketten passen bij die werkwijze, maar verschillen in grenzen en extra kosten.

Bankmutaties

Veel betalingen aan facturen koppelen

Je koppelt bankmutaties aan inkoop- en verkoopfacturen en controleert afwijkingen. Moneybird Compleet past bij veel transacties en export van je boekhouding. Ook AFAS Software, e-Boekhouden.nl, InformerOnline en Jortt passen bij deze werkwijze.

Moneybird, AFAS Software, e-Boekhouden.nl, InformerOnline, Jortt

Webshop

Orders, betalingen en uitbetalingen laten aansluiten

Je wilt orders, klantbetalingen, ingehouden kosten en bankontvangsten kunnen volgen. AFAS Software biedt met SB een beschreven werkwijze hiervoor. Bij e-Boekhouden.nl, Exact Online, Jortt en Moneybird spelen ook losse koppelingen of aanvullende voorwaarden mee.

AFAS Software, e-Boekhouden.nl, Exact Online, Jortt, Moneybird

Terugkerende facturen

Vaste facturen versturen en betalingen koppelen

Je factureert vaste contractbedragen en wilt ontvangen betalingen automatisch koppelen. Moneybird Compleet kan facturen automatisch aanmaken en versturen. AFAS Software, e-Boekhouden.nl, InformerOnline en Jortt ondersteunen ook terugkerende facturen, met eigen voorwaarden.

Moneybird, AFAS Software, e-Boekhouden.nl, InformerOnline, Jortt

Bij welke bank zit je?

We tellen alleen bankkoppelingen die de aanbieder zelf bevestigt. Staat je bank er niet bij, vraag het dan na voordat je een abonnement neemt.

  • Rabobank
    Bevestigde koppeling bij 20 van 21 programma’s.
  • ING
    Bevestigde koppeling bij 21 van 21 programma’s.
  • ABN AMRO
    Bevestigde koppeling bij 21 van 21 programma’s.
  • Knab
    Bevestigde koppeling bij 19 van 21 programma’s.

Waar let je op bij je keuze?

Vergelijk het pakket dat je echt nodig hebt, niet alleen de instapprijs. Laat ook zien wat er gebeurt als een betaling niet direct past.

Veel transacties

Controleer de grenzen van het pakket

Moneybird Compleet past bij veel bankmutaties: transacties, gebruikers en gekoppelde bankrekeningen zijn onbeperkt. Je kunt de boekhouding als auditfile exporteren. Dat bewijst niet dat alle wijzigingen blijvend worden vastgelegd. Controleer bij elk pakket de transactielimiet en welke functies in de gekozen versie zitten.

Webshop

Volg ook kosten en uitbetalingen

AFAS Software past met SB bij webshops die orders, klantbetalingen en bankuitbetalingen willen laten aansluiten. De werkwijze beschrijft ook ingehouden betaalkosten. Voor het verwerken van die kosten blijft een handeling nodig. Alleen een factuur op betaald zetten is dus niet hetzelfde als de volledige uitbetaling controleren.

SaaS

Scheid vaste facturen van abonnementenbeheer

Moneybird Compleet past bij vaste, terugkerende facturen met automatische verzending, herinneringen en bankverwerking. Dat bewijst geen ondersteuning voor factureren op basis van gebruik of het verrekenen van een deelperiode. Bij SnelStart inBalans moet je het terugkerend factureren in de beschreven werkwijze zelf starten.

Koppelingen

Controleer de hele keten

Losse koppelingen kunnen nodig zijn voor webshoporders en betalingen. Vraag naar abonnementskosten, herstel bij fouten en wie problemen oplost. Bij Moneybird moeten transactiekenmerken behouden blijven. De beschreven partnerkoppeling bij Exact Online boekt automatisch als de uitbetaling volledig aansluit.

Controle

Vraag wat je zelf moet bevestigen

Automatische matching is niet altijd automatisch boeken. Visma eAccounting geeft bij onzekerheid een voorstel dat je bevestigt of aanpast. Laat een leverancier tonen welke afwijkingen blijven staan en hoe je die herstelt. De onderzoeksresultaten zijn geen meting van de nauwkeurigheid van matching.

Welke functies heb je nodig?

Kies wat je nodig hebt. De vergelijking hierboven past zich aan.

  • Btw-aangifte
  • IB-aangifte
  • Bankkoppeling
  • Facturatie
  • Urenregistratie
  • Voorraad
  • Projecten
  • Boekhoudertoegang
  • Mobiele app
  • Auditfile-export

Zo lees je de kosten

Een boekhoudprogramma kost zelden alleen de vanafprijs. Reken met deze drie posten.

Abonnement per maand

Het bedrag dat je elke maand betaalt. Let op of de prijs geldt bij betalen per maand of per jaar.

Limieten per pakket

Veel pakketten begrenzen het aantal facturen, boekingen, gebruikers of administraties. Kom je daarboven, dan heb je een duurder pakket nodig.

Extra modules en koppelingen

Een bankkoppeling, bonnetjes scannen, een extra gebruiker of een koppeling met je webshop kost soms apart.

Welke regels blijven gelden bij automatische matching?

Automatisering helpt bij het verwerken van betalingen. Je blijft verantwoordelijk voor een controleerbare administratie en je aangiften.

Een administratie is verplicht, een bepaald programma niet

Je moet als ondernemer een controleerbare administratie bijhouden en bewaren. Daarvoor hoef je geen bepaald boekhoudprogramma te kopen. Je kunt je administratie zelf voeren of hulp inschakelen. Kies automatische matching dus om werk te besparen en controle te houden. Een softwarelicentie bewijst op zichzelf niet dat je aan de regels voldoet.

Bewaar ook de gegevens achter de boekingen

Bewaar niet alleen je eindrapporten, maar ook facturen, bankafschriften, contracten en databestanden. Voor basisgegevens geldt meestal een bewaartermijn van zeven jaar. Voor onroerende zaken en OSS gelden termijnen van tien jaar. Zorg dat je orders, betalingen, ingehouden kosten en bankontvangsten kunt blijven volgen. Een auditfile alleen is niet je volledige archief.

Matching vervangt je btw-aangifte niet

Btw-aangifte doe je meestal per kwartaal. Je eigen tijdvak en deadlines staan in Mijn Belastingdienst Zakelijk en in het bericht van de Belastingdienst. Houd berekenen, indienen, ontvangstbevestiging en betalen uit elkaar. Een bankrekening waarvan alle mutaties zijn gekoppeld, bewijst niet dat je aangifte is ingediend. Zowel je aangifte als je betaling moet op tijd binnen zijn.

Voor de KOR telt omzet, niet het transactieaantal

Voor de Nederlandse KOR mag je omzet maximaal € 20.000 per kalenderjaar zijn en gelden aanvullende voorwaarden. Je berekent dan geen btw en kunt btw op kosten en investeringen niet aftrekken. Veel kleine betalingen geven dus niet vanzelf recht op de KOR. De EU-KOR kent eigen voorwaarden en een maximale EU-omzet van € 100.000.

Buitenlandse verkopen vragen om aparte btw-controles

Bij digitale diensten aan EU-consumenten en afstandsverkopen binnen de EU kan de gezamenlijke grens van €10.000 bepalen waar je btw verschuldigd bent. Daarbij gelden voorwaarden. Ondersteuning voor Nederlandse btw-aangifte bewijst niet dat een pakket ook OSS ondersteunt. Vraag apart naar btw-tarieven per land, creditnota’s, OSS-rapportage en het bewaren van ordergegevens. Voor OSS geldt een bewaartermijn van tien jaar.

Belastingaangiften en jaarrekeningen zijn verschillende taken

Bij een eenmanszaak valt de ondernemingswinst onder de inkomstenbelasting als je aan de voorwaarden voor ondernemerschap voldoet. Een bv betaalt vennootschapsbelasting over de winst en moet doorgaans een jaarrekening deponeren. Voor een eenmanszaak geldt die deponeringsplicht niet. Controleer daarom wat een pakket precies levert: een financieel rapport is niet hetzelfde als een ingediende aangifte of gedeponeerde jaarrekening.

Scheid e-facturatieregels van aangekondigde plannen

Bij opdrachten voor de overheid kunnen eisen voor e-facturen gelden; een pdf per e-mail is niet hetzelfde. Het aangenomen Europese ViDA-pakket bevat digitale rapportage voor grensoverschrijdende zakelijke transacties in 2030. De Nederlandse plannen voor binnenlandse zakelijke e-facturatie vereisen nog wetgeving. Ze vormen nu geen algemene verplichting voor alle bedrijven. Vraag apart naar gestructureerde facturen en het gebruikte verzendnetwerk.

Controleer meer dan alleen de bankontvangst

Een netto-uitbetaling van je betaalprovider is niet je volledige verkoopadministratie. Klantbetalingen, ingehouden kosten en bankuitbetalingen zijn aparte onderdelen. Ook kan een factuur al betaald zijn voordat het geld op je bank staat. Controleer daarom regelmatig afwijkingen en bewijsstukken. Let bij je pakketkeuze bovendien op transactielimieten: onbeperkt factureren betekent niet vanzelf onbeperkt automatisch verwerken.

Hoe we onderzoeken

Wat we vergelijken

We vergelijken boekhoudprogramma’s op prijs, limieten per pakket, functies en koppelingen die de aanbieder zelf publiceert.

Waar de gegevens vandaan komen

Prijzen en functies komen uit de prijspagina’s, helppagina’s en voorwaarden van de aanbieders. Elke bewering op deze pagina hangt aan een bron in de bronnenlijst.

Wat we niet doen

We geven geen cijfer en we wijzen geen winnaar aan. Staat iets niet in een openbare bron, dan noemen we het als open punt.

Nog open op de controledatum

  • Volledig wijzigingslog: Bij geen van de onderzochte configuraties is een volledig wijzigingslog bevestigd met wie iets wijzigde, wanneer en wat er veranderde. Een auditfile bewijst dat niet.
  • Exact Online Professional: Voor Exact Online Professional zijn auditfile-export en inbegrepen terugkerende facturen niet voldoende bevestigd. Dat betekent niet dat Exact Online deze functies nergens aanbiedt.
  • Kosten van koppelingen: Van verschillende webshop- en betaalkoppelingen ontbreken volledige tarieven. Ook is niet overal duidelijk hoe btw en proefvoorwaarden worden toegepast.
  • Afwijkende AFAS-prijs: AFAS Software noemt op de prijspagina € 59,99 per maand, terwijl een ongedateerde facturatiepagina €59 noemt. De oorzaak van dit verschil is niet bevestigd; voor de vergelijking geldt de prijspagina.
  • Tijdelijke introductieprijzen: De introductieprijs van e-Boekhouden.nl voor 12 maanden en de welkomstactie van Jortt voor 3 maanden waren niet volledig verwerkt in de aangeleverde reguliere prijsgegevens. Ze vervangen de doorlopende prijzen niet.
  • Bv en jaarafsluiting: De specifieke geschiktheid van Silvasoft voor een bv is niet bevestigd. Financiële rapporten of een koppeling voor rapportage bewijzen bovendien niet dat een wettelijke jaarrekening wordt gedeponeerd.
  • Prestaties niet gemeten: De nauwkeurigheid, verwerkingssnelheid en tijdwinst zijn niet gemeten. Vraag vóór afsluiten een demonstratie met deelbetalingen, dubbele imports, terugbetalingen, terugboekingen, ingehouden kosten en niet-herkende betalingen.

Veelgestelde vragen

Wat betekent reconciliatie in mijn boekhouding?

Je controleert of facturen, betalingen en bankontvangsten op elkaar aansluiten. Bij een webshop kijk je ook naar orders en ingehouden betaalkosten. Automatische matching koppelt gegevens aan elkaar, maar afwijkingen kunnen nog controle of correctie vragen.

Welk boekhoudprogramma past bij veel bankmutaties?

Moneybird Compleet past bij veel bankmutaties door onbeperkte transactieverwerking, gebruikers en bankkoppelingen. e-Boekhouden.nl Standaard + Factureren, InformerOnline MKB Plus en Jortt Plus passen ook bij deze werkwijze. Vergelijk hun extra kosten, administratiegrenzen en manier van controleren.

Is een bankkoppeling genoeg voor mijn webshop?

Niet als je de hele geldstroom wilt controleren. Je moet ook orders, klantbetalingen, ingehouden kosten en uitbetalingen kunnen volgen. AFAS Software beschrijft die stappen voor SB. Bij andere configuraties zijn losse koppelingen nodig, waarvan je de voorwaarden en kosten apart moet controleren.

Wordt elke herkende betaling meteen geboekt?

Nee. Een programma kan ook een voorstel geven dat je eerst bevestigt. Visma eAccounting doet dat bij onzekerheid. Bij de beschreven partnerkoppeling voor Exact Online gebeurt automatisch boeken pas als de uitbetaling volledig aansluit. Vraag hoe het pakket onvolledige matches afhandelt.

Is een auditfile hetzelfde als een audittrail?

Nee. Een auditfile is een export van je boekhouding. Dat bewijst niet dat je kunt zien wie elke wijziging uitvoerde, wanneer dat gebeurde en wat de oude waarde was. De volledige diepte van zo’n wijzigingslog is voor de onderzochte configuraties niet bevestigd.

Kan ik hiermee ook mijn SaaS-abonnementen beheren?

Terugkerende facturen zijn niet hetzelfde als volledig abonnementenbeheer. Moneybird Compleet past bij vaste factuurbedragen en automatische verzending. Daarmee is ondersteuning voor facturatie op basis van gebruik of verrekening van deelperiodes niet aangetoond. Jortt factureert en boekt uitsluitend in euro’s.

Welke kosten moet ik naast het pakket controleren?

Vraag naar bankkoppelingen, webshopkoppelingen, extra gebruikers, extra administraties en scanherkenning. Bij e-Boekhouden.nl staan bank- en herkenningskosten los van het pakket. Bij InformerOnline kunnen bankkoppelingen, extra gebruikers en extra scans kosten toevoegen. Voor verschillende webshopkoppelingen zijn de volledige tarieven niet bevestigd.

Zo controleerden we deze pagina

  1. Huidige versie
    4 oktober 2026

    Eerste publicatie.